Emmanuelle FIORE

Projets

• Sélection d'oligonucléotides fonctionnels. La méthode SELEX, dont l'unité est l'un des rares laboratoires français à disposer, permet la sélection d'oligonucléotides fonctionnels, en particulier pour des cibles présentant un intérêt clinique ou toxicologique. L'objectif principal de ce projet est de sélectionner des aptamères dédiés aux biomarqueurs d'oligoéléments et des petites molécules, jusqu'aux peptides ou des protéines, tout en utilisant une alternative au SELEX : la méthode CE-SELEX.

• Mise au point de dispositifs d'analyse innovants. Ce projet comprend deux volets : d'une part, il s'agit de développer des tests de diagnostic faciles à utiliser, rapides, peu coûteux et/ou portables à l'aide d'aptamères, afin de facilité les soins aux patients ou de détecter les contaminants environnementaux ; d'autre part, l'objectif est d'établir de nouvelles stratégies de signalement pour le développement de dispositifs à haut débit et/ou haute sensibilité.

Publications

• Article • Iodinated Organic Molecule as Tag for Inductively Coupled Plasma-Mass Spectrometry Aptamer Assays [Full paper ]

  B. Billet, B. Chovelon, E. M. McConnell, D. André, L. Puillet-Anselme, E. Fiore, P. Faure, C. Ravelet, M. C. DeRosa, E. Peyrin

  Talanta, 2024, 267, 125107

• Article • Non-Competitive Determination of Small Analytes by Sandwich-type Lateral Flow Assay based on Aptamer Kissing Complex [Full paper ]

  B. Chovelon, V. Ranganathan, S. Srinivasan, E. McConnell, P. Faure, E. Fiore, C. Ravelet, E. Peyrin, M. DeRosa

  Anal. Chem. 2024, 96, 18, 6875-6880

• Article • Nile blue as reporter dye in salt aggregation based-colorimetric aptasensors for peptide, small molecule and metal ion detection [Full paper ]

  B. Chovelon, E. Peyrin, M. Ragot, N. Salem, T. Giang Nguyen, B. Auvray, M. Henry, M-A Petrillo, E. Fiore, Q. Bessy, P. Faure, C. Ravelet

  Anal. Chim. Acta, 2023, 1243, 340840

• Article • Detection of Small Molecules by Fluorescence Intensity using Single Dye Labeled Aptamers and Quencher Transition Metal Ions [Full paper ]

  B. Billet, B. Chovelon, E. Fiore, P. Faure, C. Ravelet, E. Peyrin

  Biosens. Bioelectron. 2022, 205, 114091

• Article • Aptamer Switches Regulated by Post-Transition/Transition Metal Ions [Full paper ]

  B. Billet, B. Chovelon, E. Fiore, F. Oukacine, M-A Petrillo, P. Faure, C. Ravelet, E. Peyrin

  Angew. Chem. Int. Ed. 2021, 60, 12346–12350

• Article • Anti-pesticide DNA aptamers fail to recognize their targets with asserted micromolar dissociation constants [Full paper ]

  L. Zara, S. Achilli, B. Chovelon, E. Fiore, J.J Toulmé, E. Peyrin, C. Ravelet,

  Anal. Chim. Acta 2021, 1159, 338382

• Article • Non-SELEX Isolation of DNA Aptamers for the Homogeneous-Phase Fluorescence Anisotropy Sensing of Tau Proteins [Full paper ]

  S. Lisi, E. Fiore, S. Scarano, E. Pascale, Y. Boehmann, F. Ducongé, S. Chierici, M. Minnuni, E. Peyrin, C. Ravelet

  Anal. Chim. Acta 2018, 1038, 173-181

• Article • Efficient functional neutralization of lethal peptide toxins in vivo by oligonucleotides [Full paper ]

  T. Abd El Aziz, C. Ravelet, J. Molgo, E. Fiore, S. Pale, M. Amar, S. Al Khoury, J. Dejeu, M. Fadl, M. Ronjat, G. Sotoing Taiwe, D. Servent, E. Peyrin, M. De Waard

  Sci. Rep., 2017, 7, 7202

• Article • Ultrafast Capillary Electrophoresis Isolation of DNA Aptamer for the PCR Amplification-Based Small Analyte Sensing  [Full paper ]

  E. Fiore, E. Dausse, H. Dubouchaud, E. Peyrin, C. Ravelet

  Front. Chem. 2015, 3, 49

• Article • Mirror-Image Aptamer Kissing Complex for Arginine-Vasopressin Sensing [Full paper ]

  B. Chovelon, E. Fiore, P. Faure, E. Peyrin, C. Ravelet

  Anal. Chim. Acta, 2018, 1001, 143-150

• Article • A Lifetime-Sensitive Fluorescence Anisotropy Probe for DNA-based Bioassays: the Case of SYBR Green [Full paper ]

  B. Chovelon, E. Fiore, P. Faure, E. Peyrin, C. Ravelet

  Biosens. Bioelectron. 2017, 90, 140-145.

• Article • Fluorescence Anisotropy-Based Structure-Switching Aptamer Assay Using a Peptide Nucleic Acid (PNA) Probe [Full paper ]

  E. Goux, Q. Lespinasse, V. Guieu, S. Perrier, C. Ravelet, E. Fiore, E. Peyrin

  Methods, 2016, 97, 69–74

• Article • A combinatorial approach to the repertoire of RNA kissing motifs; toward multiplex detection by switching hairpin aptamers [Full paper ]

  G. Durand, E. Dausse, E. Goux, E. Fiore, E. Peyrin, C. Ravelet, J-J. Toulmé

  Nucleic Acids Res. 2016, 44, 4450-4459.

• Article • Multi-analytical study of the binding between a small chiral molecule and a DNA aptamer: evidences for asymmetric steric effect upon 3’ vs. 5’-end sequence modification [Full paper ]

  L. Challier, R. Miranda-Castro, B. Barbe, C. Fave, B. Limoges, E. Peyrin, C. Ravelet, E. Fiore, P. Labbé, L. Coche-Guérente, E. Ennifar, G. Bec, P. Dumas, F. Mavré, V. Noël

  Anal. Chem. 2016, 88, 11963–11971

• Article • Optimisation of experimental parameters to explore small ligand-aptamer interactions by 1H NMR and molecular modelling [Full paper ]

  F. Souard, S. Perrier, V. Noel, C. Fave, E. Fiore, E. Peyrin, J. Garcia, C. Vanhaverbeke

  Chem. Eur. J. 2015, 21, 15740-15748