Sélection d'oligonucléotides fonctionnels 

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La méthode CE-SELEX (Capillary Electrophoresis-Systematic Evolution of Ligands by Exponential enrichment) est développée au sein de l’équipe NOVA. Il est à noter que le DPM est un des rares laboratoires français à posséder cette compétence.

Cette méthode est une alternative intéressante à la SELEX « classique » sur support solide. Elle permet de s’affranchir de la fonctionnalisation et de l’immobilisation de la cible et permet l’évolution de séquences hautement spécifiques et très affines plus rapidement (4 cycles de SELEX contre 10 à 15 en général). Le principe est de séparer en milieu libre, les séquences d’oligonucléotides liées à la cible (candidats aptamères) des séquences non liées en fonction de leur différence de mobilité électrophorétique (c'est-à-dire selon le rapport charge/masse) sous l’action d’un champ électrique. Après sélection et séquençage, les candidats potentiels sont caractérisés par polarisation de fluorescence, électrophorèse capillaire, ou par resonnance plasmonique de surface. Le développement d’un essai diagnostic ou une application thérapeutique est ensuite possible.

Eric PEYRIN, Corinne RAVELET

Mots-clés : Interface Chimie-Biologie, Aptamères, Cibles difficiles

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